Πάνω από τη Χώρα, στη κορυφή του λόφου στέκεται επιβλητική η μεγαλύτερη εκκλησία του νησιού, η Εκκλησία της Παναγίας η οποία είναι αφιερωμένη στην Κοίμηση της Θεοτόκου.
Ο σημαντικότερος αρχαιολογικός χώρος του νησιού περιλαμβάνει τον τεράστιο (μήκους 109 μ., πλάτους 55 μ. και ύψους 25 μ.), ιωνικού ρυθμού, ναό της Ήρας (κοινώς γνωστός με το όνομα Κολώνα,
H πανέμορφη μονή της Ζωοδόχου Πηγής χτίστηκε πάνω στο βράχο μοναδικό καταφύγιο των κατοίκων απέναντι στις πειρατικές επιδρομές.
Η Μονή των Ταξιαρχών βρίσκεται κοντά στο χωριό Γαλανή, και παρουσιάζει μεγάλο αρχιτεκτονικό ενδιαφέρον.
Το σημαντικότερο θρησκευτικό αλλά και πολιτιστικό μνημείο της Αμοργού είναι το Μοναστήρι της Παναγίας Χοζοβιώτισσας



